يركز أسلوب التمويل الذي تعتمده مبادرة الشراكة الأمريكية الشرق أوسطية على تعزيز الاستقرار والنمو الإقتصادي في مجتمعات الشرق الأوسط وشمال افريقيا من خلال تمكين الشراكة بين المواطنين والمنظمات .الحكومية وغير الحكومية والقطاع الخاص

تقوم المبادرة بطلب مقترحات المشاريع من خلال مراكزنا في المنطقة ومكاتبنا الإقليمية، وأيضا عبر الإعلان على  Grants.gov  و mepi.state.gov

ويتم اختيار منفذي مشاريع المبادرة عبر مسابقات مفتوحة، وعروض محدودة، وأحيانا من خلال منح لمشاريع مختارة مسبقا. وتُراجع جميع الطلبات لجنة مكونة من خبراء في المنطقة وخبراء في المواضيع المطروحة من وزارة الخارجية ومنظمات غير حكومية والقطاع الخاص.

 كما وتقدم المبادرة الأمريكية الشرق الأوسطية الدعم لبعض المشاريع التي تنفذها وكالات حكومية أمريكية أخرى من خلال اتفاقيات توقع بين هذه الوكالات